Σε εθνικό επίπεδο, το προσωπικό της ΕΕΑΕ συμμετέχει σε επιτροπές λήψης αποφάσεων για θέματα ακτινοβολιών, συνεισφέροντας με τον τρόπο αυτό τόσο την ρυθμιστική οπτική της ΕΕΑΕ όσο και την τεχνογνωσία του.
Το προσωπικό της ΕΕΑΕ συμμετέχει μεταξύ άλλων στις ακόλουθες επιτροπές:
Στο πλαίσιο της εποπτείας των επιπέδων ραδιενέργειας στο περιβάλλον και της αντιμετώπισης καταστάσεων έκτακτης ανάγκης σε όλη τη χώρα, η ΕΕΑΕ συνεργάζεται με δίκτυο εργαστηρίων που ανήκουν σε ερευνητικά κέντρα και ανώτατα εκπαιδευτικά ιδρύματα της χώρας.